Strandkirkefællesskabet ledes i af en bestyrelsen bestående af:
Kristian Øhrstrøm (formand, valgt på årsmøde)
Julie Vilstrup (valgt på årsmøde)
Bo Steffensen-Thomasen (valgt på årsmøde)
Søren Hartig (valgt som repræsentant for menighedsrådet)
Peter Bæk (præsterne i Strandkirken er faste medlemmer)
Den daglige administration foretages af administrator Henrik Wessing